scoup: Simulate Codon Sequences with Darwinian Selection Incorporated as an Ornstein-Uhlenbeck Process
Dit paper introduceert scoup, een R-gebaseerde codonsequentie-simulator op het Bioconductor-platform die phylogenetische en populatiegenetische concepten verenigt door het Halpern-Bruno mutatie-selectiemodel te combineren met een Ornstein-Uhlenbeck-proces om natuurlijke selectie op complexe fitnesslandschappen te simuleren.